Em nhìn thiếu mất chữ it rồi nhé: is that it is chứ không phải là is that is.

○ I think my favorite thing about the place, though, is that it is rather unassuming.
= Mặc dù vậy, tôi nghĩ điều tôi thích nhất về nơi này là việc nó thì khá khiêm nhường.

That + mệnh đề đóng vai trò là một cụm danh từ (mệnh đề danh ngữ – noun clause).